Bukkit est une API pour développeurs - elle fournit essentiellement des crochets et des fonctions que les développeurs peuvent utiliser pour se greffer à Minecraft.
Craftbukkit est le composant serveur que vous téléchargez et qui permet à ces plugins de fonctionner avec le serveur officiel de Minecraft.
Craftbukkit n'est pas encore un gestionnaire de paquets, mais plutôt une enveloppe de serveur - l'installation de plugins et les mises à jour gérées sont prévu par le biais d'un autre outil ( remplir.bukkit.org ) mais il n'a pas encore été publié - Bukkit lui-même est encore en plein développement.
Donc, pour répondre à vos trois points :
Ce que Bukkit fait que vanilla Minecraft Server ne fait pas
Bukkit en lui-même fait très peu de choses - il expose simplement une API qui peut être utilisée par les développeurs pour ajouter des fonctionnalités au jeu.
Pourquoi les gens décident de l'utiliser plutôt qu'un serveur Minecraft classique ?
Les gens l'utilisent généralement en raison des fonctionnalités supplémentaires qui peuvent être ajoutées par le biais de plugins : protection de zone, une forme d'économie, la possibilité de se déplacer à travers le monde et de rendre les chariots de mine plus stables. Un rapide coup d'œil sur le Bukkit versions de plugins Le forum vous montrera d'autres possibilités.
A quoi servent les plugins ?
Je pense que la réponse se trouve dans les deux autres - ils ajoutent des fonctionnalités supplémentaires au jeu :)