Si les deux mondes dans lesquels Booker/Comstock existent sont complètement séparés, comment l'un est-il entré dans l'autre ? Que se passe-t-il exactement dans la fin ? Pourquoi y a-t-il une référence à Rapture dans le premier jeu Bioshock ?
Booker DeWitt est en fait Zachary Comstock, comme ils sont tous deux la même personne. Booker Dewitt, après avoir traversé la guerre (bataille de Wounded Knee), une dépendance au jeu et l'alcoolisme, perd son enfant Anna pour rembourser des dettes. Après s'être remis en question, il décide de se faire baptiser. Cependant, à la dernière seconde, dans un univers, Booker rejette le baptême, et dans un autre univers, il le fait et renaît sous le nom de Zachary Comstock. Ce qui m'intrigue le plus, c'est de savoir comment Zachary Comstock entre dans le monde de Booker DeWitt.
Il devait y avoir une raison pour laquelle Zachary Comstock ne voulait pas que Booker Dewitt capture Elizabeth ; il devait qualifier Booker de faux prophète. Était-ce pour maintenir leur société en vie (si Booker montrait la "vérité" à Elizabeth, tout ce qu'ils ont créé cesserait d'exister) ?