Vous avez raison de dire que le règles d'initiative de base supposent en quelque sorte que tout le monde participe au combat au début de la bataille et n'en disent pas plus, donc l'ajout des arrivées tardives nécessite une certaine interprétation.
En général, lorsque de nouveaux arrivants prennent conscience de la bataille et souhaitent y participer, ils devraient simplement faire un jet d'initiative pour le premier tour où ils sont conscients et ensuite être placés dans l'ordre existant.
Il n'y a pas d'"attaques d'opportunité" spécifiquement accordées par l'initiative ou la surprise ; je suppose que vous faites référence au round surprise d'actions simples gratuites qui se produisent au début d'un combat lorsque certains combattants ne sont pas conscients des autres, et pendant lequel les PC non conscients sont à plat ventre à la fois pour le round de surprise et jusqu'à ce qu'ils agissent lors de leur premier round. Les règles sont écrites pour décrire le round de surprise comme étant uniquement au début du combat, mais il est certainement réaliste de dire que de nouveaux arrivants pourraient être en mesure de tomber sur des combattants actuels plus ou moins inconscients, même avec la "vue à 360 degrés" que Pathfinder offre à chacun.
Ce que je fais, c'est que si les nouveaux combattants veulent juste charger et se battre, je les mets à l'initiative. Si, par contre, ils veulent se faufiler dans le combat et prendre quelqu'un au dépourvu, alors j'utilise le test standard de Furtivité contre Perception pour déterminer la conscience à partir des règles de surprise. Si quelqu'un est surpris, je n'insère pas de round de surprise, mais j'accorde le pied plat à ses adversaires inconscients jusqu'à ce qu'ils agissent.
Exemple
Par exemple, disons que Robilar (init 11) combat deux orcs (inits 12 et 7). Deux orcs endormis, un chaman et un guerrier, entendent le combat dans une autre pièce et vont se joindre à eux. Le guerrier se jette dans la mêlée, il fait un jet d'initiative et obtient un 13. Au début du round, il se précipite sur Robilar et le découpe en morceaux, sans bonus particulier. Le chaman décide d'être sournois et veut regarder à travers une porte et sniper Robilar avec un rayon d'épuisement. Il fait un test de furtivité contre la perception de Robilar et gagne, et jette un init de 6. C'est bien, Robilar va sur 11 mais ne le voit pas, et alors le chaman zappe sa CA de contact à pied plat avec un rayon sur 6, après quoi Robilar est tout à fait conscient de lui (l'orc n'a pas assez de furtivité pour essayer de vrais trucs de sniper avec une peau à -20, donc il pousse juste la porte jusqu'au bout et se bat normalement).
À mon avis, cela permet de concilier le respect des règles, la rapidité de résolution et le réalisme du résultat.