---Note : Les liens peuvent contenir des spoilers!---
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Les seules factions mutuellement exclusives dans le jeu de base sont celles qui représentent les deux côtés de la guerre civile de Skyrim.
Il est également important de mentionner ici que votre choix de qui suivre tôt dans le jeu (Ralof ou Hadvar), en fuyant Helgen, ne détermine pas dans quel groupe vous vous engagez par la suite.
Les deux chemins se rejoignent essentiellement à Riverwood, lorsque des membres de la famille de chaque camp vous suggèrent d'apporter des nouvelles de Helgen au Jarl Balgruuf le Grand à Blancherive.
Le PNJ que vous suivez hors de Helgen, ou un membre de leur famille, vous invitera à rejoindre leur cause. Cela ajoutera une quête à votre journal, mais ne constituera toujours pas un engagement de votre personnage envers cette faction. Ensuite, vous êtes libre de rejoindre le camp que vous souhaitez dans la guerre (ou aucun).
Une quête pour rejoindre le camp opposé peut généralement être obtenue en rencontrant simplement l'un de leurs soldats dans une ville ou un camp qu'ils contrôlent. Le soldat vous suggérera de rejoindre leur cause, et cette quête sera alors ajoutée à votre journal. Une fois que vous avez expressément déclaré votre allégeance, cependant, vous échouerez dans la quête pour le camp que vous avez choisi d'opposer.
Vous avez encore une chance de changer de camp pendant Le Sceptre d'os. Livrez simplement le sceptre au chef de l'opposition, et vous rejoindrez leur cause à la place.
Tout cela étant dit, il existe plusieurs autres factions auxquelles vous pouvez librement adhérer. Rejoindre l'une de ces factions ne vous empêchera pas de rejoindre les autres. Cela n'affectera pas non plus, et ne sera pas affecté par, votre choix concernant la guerre.
Près ou à la fin des lignes de quête pour la plupart des groupes, vous finirez généralement par devenir le leader du groupe. Cela n'affectera pas non plus votre capacité à rejoindre ou diriger d'autres factions.
*La quête pour rejoindre la Confrérie Noire commence en fait à Havreciel.
**Il y a (en supposant que vous poursuivez la quête principale jusqu'au bout) une quête inévitable qui vous place au milieu d'un conflit entre les Lames et les Grises-Barbes. Votre décision (ou même l'absence de décision) dans cette affaire vous empêchera d'accéder à certaines ressources disponibles via la faction que vous avez choisie d'opposer. Je ne liste pas ces factions comme "mutuellement exclusives" cependant, car vous ne rejoignez jamais correctement les Grises-Barbes.
Le DLC Dawnguard ajoute deux nouvelles factions rejoignables par le joueur, qui sont également mutuellement exclusives.
Note : Bien que ces deux factions finissent par devenir mutuellement exclusives, vous devez suivre une partie de la quête initiale de Dawnguard avant d'avoir l'option de rejoindre les Volkihar.