Oui, c'est faisable, mais vous aurez besoin, comme ratchet freak l'a souligné, d'une copie séparée de Minecraft pour chaque jeu de mods. multiMC est une façon de le faire, mais si vous passer au nouveau lanceur vous pouvez créer des profils personnalisés, chacun avec un ensemble de mods distinct, pour vous faciliter encore plus la tâche (cf. aquí pour plus de détails, car le nouveau lanceur ajoute quelques étapes au processus de modélisation).
De plus, une fois que le nouveau lanceur sera plus mature et que Mojang aura enfin mis en place un support officiel pour les mods, le processus d'activation et de désactivation des mods sera probablement encore plus facile.