Comme le dit @aaron9eee , il n'est jamais trop tard pour appliquer les règles telles qu'elles sont écrites (RAW) .
Cependant, vous dites que vous n'en avez pas encore parlé à votre joueur. Cela devrait être votre première étape ! Votre joueur sait clairement que quelque chose ne va pas, alors prenez-le à part en dehors du jeu et avouez-lui : "J'ai récemment découvert que nous avons mal géré certaines des caractéristiques des moines. L'équilibre du jeu repose sur le fait que nous utilisons ces fonctionnalités de la bonne manière afin que tout le monde puisse s'amuser. Je suis désolé de ne pas l'avoir remarqué plus tôt !"
(Remarque : je préfère utiliser le terme "nous" dans ce genre de conversation ; cela évite de donner l'impression que vous les accusez de tricher ou d'être "stupides" d'une manière ou d'une autre. Et cela permet de reconnaître que vous auriez pu consulter les règles plus tôt mais que vous ne l'avez pas fait, afin qu'ils ne se sentent pas seuls dans cette situation).
Après cela, écoutez le lecteur. Il est probable qu'il s'inquiète de ce que cela signifie pour son personnage à l'avenir, surtout s'il a fait des choix de niveaux basés sur des règles incorrectes. Je recommanderais d'offrir au joueur une chance gratuite de reformater/se spécifier selon le livre. Ils ont ainsi l'impression de participer à la correction des décisions erronées, plutôt que d'être simplement punis.
Si vous n'êtes pas à l'aise pour autoriser un respec, écoutez quand même les préoccupations de votre joueur et faites de votre mieux pour trouver des moyens de l'aider à s'adapter au jeu en RAW. Rappelez-vous, et rappelez-leur, que vous ne faites pas cela pour les punir. Vous faites cela parce que vous voulez que le jeu soit amusant et cela signifie que vous devez vous assurer que vous utilisez le système correctement. (ou du moins, faire des choix éclairés sur le moment et la manière de faire du homebrew).
En fait, j'ai eu cette conversation la semaine dernière avec mes joueurs après que nous soyons tous passés à un nouveau système et que plusieurs personnes aient réalisé qu'elles avaient mal compris le fonctionnement de leurs classes. J'ai fixé des limites au respec - pas de refonte complète du concept du personnage, mais les ajustements des bonus de stat, les exploits, les sorts, etc. étaient tous acceptables. Certains de mes joueurs m'ont pris au mot ; je pense qu'au moins un autre a choisi de ne pas le faire parce qu'il considère que c'est un défi intéressant de jouer le personnage tel qu'il a été construit à l'origine, même s'il ne comprend pas les mécanismes. Dans tous les cas, la chose la plus importante pour mon groupe a été de reconnaître le problème et de se mettre d'accord sur une solution.