C'est un peu tard, mais je vais ajouter plus d'informations. Ma source est cette page wikia qui, à son tour, fait référence à Final Fantasy IX Ultimania . Je cite :
Vivi est un mage noir créé à Dali à la demande du royaume d'Alexandrie, après que la reine Brahne a appris l'existence de cette technologie par Kuja. Vivi est un prototype de mage noir qui est tombé du cargo dans une forêt près de la ville de Treno. Un mois plus tard, il a été découvert par un Qu nommé Quan qui l'a élevé dans l'espoir qu'il devienne assez grand pour qu'il puisse le manger, mais au bout de six mois, Vivi était toujours aussi petit qu'avant.
Vivi ne se doutait pas des intentions de Quan et vivait heureux avec son "grand-père" dans la Demeure de Quan. Pendant cette période, Quan nomma Vivi et lui apprit beaucoup de choses sur le monde, éveillant en lui la curiosité de le découvrir par lui-même. À la mort de Quan, Vivi resta seul. Une semaine plus tard, il se rendit dans la ville voisine de Treno et obtint un billet pour une pièce de théâtre. Le lendemain, il prit en stop le dirigeable d'un noble pour Alexandrie.
C'est à ce moment-là que le jeu commence et vous connaissez déjà cette partie.
Quant aux autres mages noirs du village, il semble qu'au bout d'un certain temps, leur enchantement ait commencé à s'estomper ou ait été rompu. Cela a entraîné leur "réveil" et la formation de leur propre communauté. Par exemple, l'histoire de N° 288 :
Non. 288 était autrefois un simple soldat mage noir au service d'Alexandrie. Le jour où il a acquis sa sensibilité, il l'a décrit comme un réveil soudain d'un état d'hébétude, et a été horrifié par la vue d'un soldat couvert de sang gisant devant lui. Il s'est enfui et a trouvé d'autres personnes comme lui sur les lieux, et ils ont erré sur Gaïa jusqu'à ce qu'ils entendent parler du Village des Mages Noirs et qu'ils s'y rendent.