La Frappe Etonnante est en plus de tout dommage causé par l'attaque.
Il n'y a rien dans la formulation de l'effet qui indique que les autres effets de l'attaque au corps à corps sont modifiés par l'utilisation de la frappe étonnante :
Lorsque vous touchez une autre créature avec une attaque au corps à corps, vous pouvez dépenser 1 point de ki pour tenter une frappe étonnante. La cible doit réussir un jet de sauvegarde de Constitution ou être étourdie jusqu'à la fin de votre prochain tour.
(PHB, p. 79, souligné par moi). Notez le texte en gras : la frappe étonnante n'est pas elle-même une attaque au corps à corps; c'est un effet qui peut être appliqué lorsqu'une attaque au corps à corps touche.
Comparez cela à la description de l'option de combat Désarmer (DM p. 271, souligné par moi) :
L'attaquant fait un jet d'attaque contesté par un jet de Force (Athlétisme) ou de Dextérité (Acrobaties) du défenseur. Si l'attaquant remporte le concours, l'attaque ne cause aucun dommage ni autre effet néfaste, mais le défenseur laisse tomber l'objet.
Les règles de la frappe étonnante n'ont pas un tel langage indiquant que les effets réguliers de l'attaque ne se produisent pas.