Le choix effectué à ce stade du jeu marque le début d'une ligne de quête avec chaque faction.
Si vous terminez l'intercepteur de signaux avec le chemin de fer, la quête à réaliser à l'Institut s'appelle Underground Undercover, dans laquelle vous entrez en contact avec un scientifique à l'intérieur de l'Institut et coordonnez un soulèvement des synthés. Desdemona sera responsable et Tinker Tom s'en chargera.
Si vous l'accomplissez avec les Minutemen, vous obtenez une quête intitulée Inside Job, qui mène à la destruction de l'Institut. Si vous choisissez l'une des autres factions pour construire l'intercepteur de signaux mais que vous êtes ensuite expulsé de l'Institut, vous pourrez parler à Preston et poursuivre la quête des Minutemen. Preston sera responsable des Minutemen et c'est Sturges qui déchiffrera les plans.
Si vous construisez l'intercepteur de signaux avec la Confrérie de l'acier, vous obtiendrez la quête De l'intérieur. Cette quête vous demande de tenter de recruter un scientifique de l'Institut. L'aîné Maxson est responsable et le scientifique est Proctor Ingram.
Ce choix ne vous enferme pas dans l'une de ces factions, cela se produit plus tard dans le jeu et dépend de choix sans rapport avec cette quête. .
