Le navire, Orphéon était d'origine pirate de l'espace, donc nous pouvons exclure que la balise de détresse ait été causée par une attaque pirate de l'espace.
Le journal de bord contient des informations qui nous donnent un aperçu des événements qui ont précédé l'atterrissage de Samus :
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"Entrée de la capsule de sauvetage. Le vaisseau a déjà été largué. L'évacuation a eu lieu 6 heures avant votre arrivée."
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"Zebes est tombée. Tout le personnel au sol est présumé mort, soit tué par le Chasseur revêtu de métal, soit dans la destruction ultérieure des installations souterraines. Nos frégates de recherche Orphéon, Siriacus et Vol Paragom étaient en orbite à l'heure zéro et ont réussi à battre en retraite. La frégate Orphéon est maintenant amarrée à l'avant-poste de Vortex. La cargaison de l'Orphéon semble avoir un taux de survie de 100 % ; les Métroïdes sont en bonne santé mais leur programme d'alimentation est restreint en raison de l'état incertain de l'approvisionnement. Nous sommes prêts à commencer les recherches sur les Métroïdes et autres formes de vie prometteuses. Le statut de sécurité reste en code bleu ; aucun signe de poursuite de la part du chasseur." - Chute de Zebes
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"Femme parasite, génétiquement améliorée par des moyens inconnus. Un point faible a été détecté dans la bouche de cette créature. Utilisez votre autociblage pour acquérir cette nouvelle cible ! Les scans indiquent la présence d'un puissant mutagène, d'origine inconnue. La créature a la capacité de tirer des explosions d'énergie à partir de sa bouche, un trait qui n'est pas présent dans le génome standard des parasites. Il semble que les Pirates ont commencé un programme de bio-ingénierie, avec des résultats considérables." - Reine des parasites
Regardons également ce que certains des pauvres pirates de l'espace ont dû affronter :
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"Statut >> Mort causée par une section de la moelle épinière."
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"Statut >> Mort causée par de graves dommages causés par les flammes à l'exosquelette."
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"L'analyse détecte de grandes quantités de sang manquant sur les carcasses. Ces corps ont pu être utilisés pour se nourrir. Le modèle correspond au comportement d'un prédateur."
En effet, il y avait beaucoup de pirates de l'espace morts quand nous sommes arrivés là-bas, et ils avaient tous des dégâts incompatibles avec le type d'armement de l'univers Metroid Prime. Nous trouvons également une Reine Parasite morte dans la zone de l'île. Zone d'évacuation d'urgence avec 3 capsules de sauvetage larguées. Nous pouvons en déduire que les pirates de l'espace ont été poursuivis par cette reine parasite jusqu'à la zone d'évacuation où certains ont survécu, mais la plupart des pirates à bord de l'Orphéon ont péri. La Reine Parasite se déplaçait librement, et il y avait beaucoup de corps partout pour se nourrir. Ces événements se sont produits juste 6 heures avant l'arrivée de Samus sur l'Orphéon.
Maintenant, qu'en est-il de ce qui a causé ça en premier lieu ? On ne peut que supposer que les pirates se sont faits eux-mêmes. Phazon était présent sur Orphéon, ainsi qu'un certain nombre de Métroïdes et autres créatures en parfaite santé. Les pirates ont manifestement fait beaucoup d'expériences sur ces créatures, comme le montre la Reine Parasite et les nombreux scans à bord d'Orphéon des expériences ratées. Deux Reines Parasites se sont échappées, celle qui est morte dans la zone d'évacuation et celle que vous combattez dans le jeu. Bien qu'il soit possible que d'autres créatures se soient échappées, la plupart d'entre elles étaient encore en sécurité dans le confinement lorsque Samus a traversé le vaisseau et ne pouvaient pas faire grand-chose. Nous pouvons supposer que seules les Reines Parasites et les Parasites ont réussi à s'échapper et à ravager la frégate.
Sur cette base, nous pouvons conclure que les pirates de l'espace ont envoyé le signal de détresse à peu près au moment où ils ont tenté de s'échapper.